顾委会：由名誉会长、顾委会主任、专家顾问、政府要员、知名吴氏企业家组成。

理事会：原则上规模在10000人以内，由全体理事（含区县理事代表）组成；常务理事会由总会长、常务副总会长、副总会长、总会长助理、秘书长及重庆市部分优秀吴氏宗亲组成。

党总支：总会拟成立党组织，各分会拟成立党支部；

监事会：监事原则上规模在10人以内，由渝吴总会监事、区县监事代表组成；监事长可由党组织负责人兼任。

秘书处：由渝吴总会的秘书长、副秘书长、职能部门负责人组成。

区县分会：由各区县籍吴氏理事组成；区县分会会长由总会长办公会提名，各分会的理事大会选举产生；没有成立区县分会者，设区县工作站，其站长由渝吴总会理事会任命。

行业分会：按照行业（建筑装饰、文化艺术、教育科技、人力资源、卫生康养、旅游餐饮、工业制造、乡村振兴等）大类划分，根据理事需求，自愿进入行业开展项目运营工作；行业分会会长由总会长办公会提名，各行业分会的理事大会选举产生。